El primer Comisario de Pesquisas fue Eduardo M. Álvarez, quien estuvo a cargo de la investigación del doble filicidio cometido por Francisca Rojas, en Necochea. Fue así que aplicó el sistema dactiloscópico, creado por el prestigioso Juan Vucetich y logró esclarecer el crimen. No sólo causó conmoción en la época, puesto que la mujer trató de simular un ataque de su vecino Pedro Velázquez, sino que hasta el día de hoy el caso es recordado en los anales de la criminología. Posteriormente, el Comisario Álvarez tuvo un merecido ascenso y fue nombrado Jefe de Policía Interino al producirse la dimisión del Coronel Dantas, en 1893.
Desde su origen a la fecha la Comisaría de Pesquisas tuvo diversas denominaciones: en 1907, Comisaría de Investigaciones; en 1936, División Investigaciones; en 1954, Dirección de Investigaciones; en 1977, Dirección General de Investigaciones; en 1998, Dirección General de Investigaciones en Función Judicial y, a partir del 2004 hasta la fecha, Superintendencia de Investigaciones en Función Judicial.
Asimismo, con el trascurrir de los años, por el crecimiento orgánico de la repartición se fueron agregando dependencias mientras que otras se independizaron o comenzaron a funcionar en otras áreas de conducción, de acuerdo a las necesidades operativas de la Fuerza.
Actualmente, la Superintendencia de Investigaciones en Función Judicial de la Policía de la provincia de Buenos Aires es un organismo modelo en su género y mantiene –a través de INTERPOL- una constante y productiva relación con las mejores policías del mundo para combatir el delito.
En Balcarce, impulsada por el Intendente Municipal José Enrique Echeverría, juntamente con el titular de la Unidad Funcional de Instrucción, Juicio y Ejecución Descentralizada Dr. Rodolfo Moure con el objetivo de contar con un elemento de la especialidad Investigaciones en ese Partido, con fecha 26 de junio de 2010 se creó por resolución 467/2010 del entonces Ministro de Justicia y Seguridad Ricardo Casal la Sub Delegación Departamental de Investigaciones en Función Judicial Balcarce -SubDDI-.